ماژول غشایی: این جزء اصلی یک MBR است که معمولاً از مواد غشایی میکروفیلتراسیون یا اولترافیلتراسیون تشکیل شده است. مواد متداول عبارتند از PVDF، PVDF اصلاح شده یا پلی اتر سولفون. الیاف غشایی یا غشاهای ورقه ای به روش خاصی چیده شده اند تا یک لایه فیلتراسیون با اندازه منافذ یکنواخت تشکیل دهند که برای حفظ لجن فعال، جامدات معلق و میکروارگانیسم ها استفاده می شود و در عین حال اجازه عبور آب تمیز را می دهد.
ساختار تکیه گاه غشایی: این ساختار برای تثبیت و محافظت از الیاف یا ورق های غشایی استفاده می شود. سازه های رایج شامل قاب های فیبر توخالی یا قاب های غشایی ورق می باشد. این قسمت استحکام مکانیکی و مقاومت در برابر رسوب ماژول غشا را تعیین می کند. ساختار پشتیبان همچنین کانال‌های جریان را برای ایجاد حالت جریانی از مشروب مخلوط بر روی سطح غشاء و کاهش رسوب آلاینده را در خود جای داده است.
سیستم عامل: این شامل یک سیستم هوادهی، یک سیستم مکش و یک سیستم شستشوی معکوس است. سیستم هوادهی با هم زدن سطح غشا با حباب های هوا رسوب غشاء را کاهش می دهد. سیستم مکش فشار منفی را برای نفوذ در لایه غشا فراهم می کند. و سیستم شستشوی معکوس به طور دوره ای انسداد منافذ غشایی را برای بازگرداندن شار از بین می برد. این سه جزء با هم کار می کنند تا از پایداری و کارایی تصفیه غشاء MBR در طول کارکرد طولانی مدت اطمینان حاصل کنند.